基因组de novo (动植物,真菌,细菌,病毒)
一、产品介绍
De novo基因组组装,即从头测序组装,是指不依赖于任何现有参考序列,直接通过先进的测序技术(如PacBio、Nanopore、Illmina、BGI-T7测序技术)对生物体的全基因组进行测序,并对序列进行拼接与组装,从而得到该物种的完整基因组序列图谱。
二、测序方案
用于基因组survey分析可选用BGI T7二代全基因测序数据或PacBio HiFi测序数据,因此BGI T7的二代全基因组测序可选做。
基因注释所需的二代转录组测序与三代全长转录组测序可都测或二选一即可,但三代全长转录组所作基因注释准确性更高。
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测序平台
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测序文库
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数据量
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二代测序
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BGI T7
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Hi-C文库
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100×
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二代测序
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BGI T7
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WGS文库
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50×
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二代测序
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BGI T7
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转录组文库
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6 Gb/每样
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三代测序
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PacBio Revio
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HiFi文库
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30×
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三代测序
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PacBio Revio
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转录组文库
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100GB |
三、技术路线